电影的时间设定在恐龙大闹 圣地亚哥事件 四年后（ 第二部的事件四年后）。一名小男孩玩 滑翔翼不幸失踪在索纳岛上。他的父母富商保罗与前妻葛放辨劝阿曼达请求恐龙专家格兰特博士前往搭救。艾伦·格兰特博士（ 山姆·尼尔 饰）无论如何也不愿再返回那个鬼地方。虽然发下重誓，但现状不得不让他收回誓言...
